Le référentiel de la qualification Animal&Cité® s’articule autour de 4 axes essentiels pour des programmes exemplaires et durables. Ceux-ci sont déclinés en 18 thèmes et  33 critères, eux-mêmes divisés en exigences dont certaines sont dites de bases et d’autres recommandées.

   Le référentiel se veut pragmatique, pertinent et ayant une logique d'accompagnement et d'amélioration continue. C'est pourquoi son objectif principal est bien la mise en place d'une pratique durable, éthique et sociale.